Основными направлениями научной деятельности Института являются:
- теория и практика информационно-коммуникационных систем;
- теории информации, кодирования и управления;
- многокомпонентные случайные системы, теория и моделирование;
- фундаментальные физические основы передачи информации
- информационные процессы в живых системах и биоинформатика;
- компьютерная лингвистика и моделирование естественного языка.