Тема: оценка схожести гистологических изображений для задачи виртуального окрашивания
Описание: Виртуальное окрашивание — перспективный метод в цифровой патологии, позволяющий ускорить дорогостоящие лабораторные процедуры генерацией изображений с нужным типом окрашивания с помощью нейросетей. Для обучения моделей pix2pix используются пары изображений, полученные с разных срезов ткани, окрашенных разными красителями. Даже после хорошей регистрации между изображениями могут сохраняться различия — локальные смещения, деформации или частичная потеря структуры. Чтобы исключить "плохие" пары, требуется надежная оценка их схожести.
Что предстоит: - Провести сравнительный анализ методов оценки схожести пар изображений:
— классические метрики (SSIM, PSNR, Mutual Information)
— глубокие метрики на основе нейросетей (LPIPS, DISTS)
— пространственные методы, учитывающие локальные и глобальные смещения (non-rigid transformation)
- разработать и обучить собственную модель оценки схожести, сравнить ее с существующими методами
- подготовить рекомендации по фильтрации данных перед обучением моделей виртуального окрашивания
Ожидаемый результат: Обученная модель оценки схожести; анализ и сравнение существующих подходов; выводы о пригодности разных методов для фильтрации пар изображений
Куратор: Светлана Илларионова,
@illarionova_svetlana